Действие мутагенов может вызывать следующие нарушения.
1. Инактивирующие повреждения. Это повреждения ДНК, при которых невозможна ее репликация. Если такие повреждения не ликвидируются соответствующими системами репарации, то клетка погибает.
2. Собственно мутагенные повреждения. Это повреждения, которые не нарушают репликацию ДНК, но изменяют последовательность азотистых оснований в ее цепях.
Большинство мутагенов вызывает как инактивирующие, так и собственно мутагенные повреждения ДНК.